直接威胁

不可持续的捕捞

全球55%的珊瑚礁受到了过度捕捞的影响。

当鱼类种群数量减少时，尤其是以藻类为食的鱼类，藻类就会肆意生长，最终导致珊瑚窒息而死。其他不可持续的捕捞方式则会物理性地摧毁整片珊瑚礁——例如，炸鱼捕捞仅需一次爆炸，就能摧毁64平方英尺（5.9平方米）的珊瑚礁。

陆源污染

全球25%的珊瑚礁受到农业径流的影响。

流入珊瑚礁的废水形式多样——包括生活污水、农业径流、工业废水排放等。当废水进入海洋环境时，会携带来对珊瑚礁和人类有害的化学物质和细菌。此外，废水还携带营养物质，这些物质会促进藻类的生长。如果沉积物通过径流进入海洋，还会阻挡珊瑚生存所必需的阳光。

栖息地破坏

全球27%的珊瑚礁位于保护区内，但其中只有6%得到了妥善管理。

不可持续的旅游活动和沿海开发会对珊瑚礁造成持久的破坏。诸如触摸或踩踏珊瑚礁，以及在未采取适当预防措施的情况下在离海岸线过近的地方建造建筑物和道路等行为，都会瞬间破坏拥有数千年历史的珊瑚礁。不可持续的航行行为，例如在珊瑚礁上抛锚，也会造成破坏。